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Syndicat des Sélectionneurs Avicoles et Aquacoles Français |
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[SELECTION AVICOLE]
[SELECTION AQUACOLE]
 Sélection Avicole :
- en préparation
Sélection Aquacole :
- Sélection des espèces aquacoles
- La sélection des espèces aquacoles est conduite par des entreprises ou des groupement d’entreprises qui souhaitent
améliorer la qualité, l’aptitude à l’élevage et à la transformation de leurs alevins ou de leurs naissains.
- La lourdeur des investissements et l’incertitude de la bonne conduite des programmes de sélection sur la durée ont
conduit un nombre limité de PME pionnières à se regrouper dans le cadre du SYSAAF pour développer un savoir-faire
technologique commun en
matière d’amélioration génétique des espèces aquacoles.
- Ce savoir-faire résulte des travaux de recherche conduits en
partenariat avec les sélectionneurs et différents organismes de recherche dont l’INRA et l’IFREMER. De l’ordre de 50 %
de notre activité est dédiée à l’amélioration des procédures de sélection.
- Programmes de sélection massale adaptés à des PME
- Pour des PME, l’investissement dans des programmes de sélection massale est généralement la première étape avant
d’investir ultérieurement dans des programmes de sélection familiale leur permettant la prise en compte d’un plus
grand nombre de caractères et l’utilisation des informations collectées sur plusieurs générations avec le BLUP.
- Le SYSAAF transfert auprès des sélectionneurs les principes de la procédure de sélection massale optimisée PROSPER
sur la croissance validée par l’INRA. Cette procédure de sélection a démontré des gains de poids à âge égal de 15
à 30 % par génération chez la truite et le bar.
Outre la sélection sur la croissance avec contrôle des effets maternels
initiaux et des effets sociaux par troncatures successives, le SYSAAF propose aussi d’inclure différents critères de
qualité grâce aux travaux conduits en partenariat avec les sélectionneurs et les organismes de recherche
(INRA, CEMAGREF, IFREMER). En sélection massale, les critères doivent être évalués sur animaux vivants.
- Le SYSAAF a validé différentes méthodes de mesures non létales pour sélectionner sur la teneur en lipides des filets
par micro-ondes (Fatmeter), sur l’épaisseur du filet par ultrasons et sur le rendement à l’éviscération
par notation morphologique.
D’une mise en œuvre simple, ces différentes méthodes permettent l’intégration de critères qualitatifs dans les programmes
de sélection massale.
- Traitement des données et indexation des reproducteurs
- Le SYSAAF accompagne les entreprises dans la définition et la mise en œuvre de leurs programmes de sélection.
A partir des connaissances scientifiques sur l’amélioration génétique des animaux domestiques et des dernières
innovations dans le domaine aquacole, chaque sélectionneur choisit ses investissements en fonction de ses objectifs
économiques et de ses capacités d’investissement.
Si la sélection sur la vitesse de croissance constitue un objectif
souvent important, le SYSAAF a développé différents savoir-faire technologiques pour sélectionner sur des critères
de qualité de la chair ou des carcasses (teneur en lipides des filets, pigmentation de la chair, rendements de découpe,
épaisseurs des filets), utiliser les biotechnologies de la reproduction adaptée et limiter les pertes de
consanguinité.
- A chaque intervention, le sélectionneur saisit dans le système de base de données INFAQUA les diverses
informations nécessaires à la sélection. Ces données sont transmises au SYSAAF qui les traite avec divers logiciels
ou programmes informatiques spécialisés pour estimer les valeurs génétiques, choisir les individus sur leur
performance propre (sélection massale) ou sur la performance d’apparentés et/ou d’ascendants (sélection familiale)
et pour proposer les meilleurs appariements afin de limiter la consanguinité.
- Le SYSAAF a développé un programme informatique qui
optimise les propositions d’accouplement en fonction de la généalogie des candidats pour la sélection ou la multiplication.
Un plan de croisement est pré-établi avant la reproduction sur la base de la généalogie et de la valeur génétique des
candidats. Des adaptations peuvent être nécessaires lors de la collecte des gamètes des parents. A la demande du
sélectionneur, le SYSAAF propose alors les meilleures autres options possibles.
- Utilisation des empreintes génétiques en sélection aquacole
- En sélection animale, la connaissance des généalogies est déterminante, que ce soit pour limiter la consanguinité
en évitant de croiser des individus apparentés ou pour estimer les valeurs génétiques des candidats sur la base
de leurs performances et
de celles d’apparentés. En agriculture, les éleveurs identifient leurs animaux dès la naissance avec des bagues posées à
l’aile (oiseaux) ou des boucles posées à l’oreille (mammifères). La petite taille à l’éclosion des espèces aquacoles rend
ce marquage précoce impossible. La seule solution consistait à élever les descendants de chaque famille dans autant de
bassins que de famille (> 200 / génération) jusqu’à ce que les animaux atteignent une taille minimum (35-50 g) à laquelle
leur identification individuelle par transpondeur RFID est possible. Ce type de programme de sélection implique des frais
d’investissement et d’élevage coûteux que seules des entreprises de très grande taille peuvent assumer. De plus,
l’impossibilité de dissocier la performance familiale de l’effet du bassin réduit la précision de l’estimation de
la valeur génétique des individus.
- Pour contourner cette difficulté, et comme développé chez l’Homme, le SYSAAF a investi dans le transfert de la
technologie des empreintes génétiques en partenariat avec le laboratoire d’analyse LABOGENA.
Les avancées récentes en biologie moléculaire ont montré que chaque individu présente une signature génétique
unique due à la variabilité entre individu du nombre de répétition de fragments des chromosomes dans des régions
non codantes de notre ADN. Chaque sélectionneur, après envoi à LABOGENA d’un échantillon de nageoire, de sang ou
de manteau (huître) dans de l’alcool peut ainsi identifier a posteriori la généalogie de ses animaux en sélection,
même à partir de très nombreux parents potentiels. Cette innovation a profondément modifié la structure des programmes
de sélection de type massale ou familiale. De plus, le regroupement des candidats dans un même bassin dès l’éclosion
réduit les effets « bassin », améliore fortement la qualité des estimateurs génétiques et donc améliore l’efficacité
des programmes de sélection.
- Le typage ADN, déjà développé chez la truite arc-en-ciel, le bar, la daurade, le turbot et l’huître, sécurise la
gestion génétique en sélection massale en évitant de croiser des individus apparentés. De plus, sa simplicité de
mise en œuvre permet le développement de programmes de sélection combinant une sélection massale pour des caractères
externes et une sélection familiale sur apparentés pour des caractères létaux impliquant par exemple une découpe
(rendement à l’éviscération, rendement au filetage, pigmentation de la chair, etc.) tout en limitant le nombre
d’individus à génotyper à son minimum nécessaire.
- INFAQUA : une gestion sécurisée des données
- Le SYSAAF a développé un système de base de données « INFAQUA » adapté à la sélection des espèces aquacoles.
Ce système, élaboré en collaboration avec les sélectionneurs et à partir de l’expérience antérieure des
sélectionneurs avicoles, permet de saisir sur ordinateur portable au bord du bassin les performances relatives
à un individu marqué par transpondeur RFID ou à un lot de poissons.
Avec « INFAQUA », le sélectionneur et le
SYSAAF peuvent avoir accès instantanément et de façon sécurisée à toutes les performances enregistrées sur
l’ensemble des générations connues pour choisir de façon optimale les candidats les plus intéressants sur
leur généalogie et leur valeur génétique.
INFAQUA constitue un outil de travail déterminant pour extraire
facilement les données phénotypiques, les normaliser et les préparer pour des traitements génétiques adaptés (BLUP).
- Gestion de la reproduction, des gamètes et de la cryoconservation du sperme
- Le SYSAAF a acquis un savoir-faire unique en matière de gestion des gamètes et de la reproduction des espèces
aquacoles pour faire reproduire les candidats sélectionnés et diffuser le progrès génétique aux clients des
sélectionneurs.
- Différents dilueurs de collecte, de conservation et de congélation du sperme de poissons et d’huître
(StorFish, StorGigas, OvaFish, CryoFish et CryoGigas) ont été développés et commercialisés par IMV sous
Licence INRA-IMV-SYSAAF. Le sperme frais peut ainsi être conservé plusieurs jours avant son utilisation.
- Le SYSAAF a développé une procédure de congélation du sperme sur site incluant l’impression des paillettes,
le remplissage, la soudure automatisée des paillettes et la congélation en vapeur d’azote en conditions contrôlées.
Plusieurs sélectionneurs ont développé leur cryobanque pour conserver leur ressource génétique, sécuriser génétiquement
et sanitairement leur sélection, ou diffuser préférentiellement certains individus.
- En partenariat avec plusieurs entreprises de sélection, le SYSAAF a participé à l’étude d’Autorisation de Mise sur
le Marché (AMM) pour la société Intervet du premier GnRH inducteur de ponte enregistré au plan Européen par l’EMEA,
le « Gonazon ». Cette technologie sécurise les programmes de sélection en maximisant les chances de faire reproduire
au moment voulu les candidates sélectionnées.
Etat sanitaire & Hygiène des lignées sélectionnées :
- La sélection, opération à long terme, peut être compromise par des maladies apparaissant sur
des lignées sélectionnées. Une attention particulière est donc consacrée au maintien d'un bon état sanitaire
(en particulier celui concernant les maladies infectieuses à transmission verticale) des lignées sélectionnées
et à leur protection.
Une surveillance sanitaire régulière des cheptels ainsi que des mesures de
biosécurité strictes permettent d'atteindre ces objectifs.
Audit des sélectionneurs selon des référentiels approuvés par l'INAO :
Le respect d’un référentiel permet d'apporter des garanties sur la maîtrise des moyens et sur
l'exercice des compétences qui caractérisent le métier de sélectionneur : infrastructures et moyens
nécessaires, conditions minimales d'organisation et de réalisation des activités de sélection, nombre
et nature des critères sélectionnés, conditions sanitaires d'exploitation des lignées sélectionnées et
de production des reproducteurs parentaux.
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